Sektori
Kabinet ministra
Sektor za političke i ekonomske kriterijume u procesu pristupanja Evropskoj uniji
Sektor za koordinaciju procesa usklađivanja nacionalnih reformi sa politikama i instrumentima EU za dostizanje zelenog dogovora i održivog razvoja
Sektor za planiranje, programiranje, praćenje i izveštavanje o sredstvima EU i razvojnoj pomoći
Sektor za programe prekogranične i transnacionalne saradnje i saradnju sa organima i organizacijama na lokalnom i regionalnom nivou radi efikasnijeg korišćenja fondova
Sektor za komunikacije i obuku i pripremu srpske verzije pravnih tekovina Evropske unije
Sekretarijat Ministarstva
Grupa za analitičku i stručnu podršku Glavnom pregovaraču u procesu pregovora o pristupanju Evropskoj uniji
Odsek za pripremu, sprovođenje i praćenje sprovođenja projekata koji se finansiraju iz fondova Evropske unije
Grupa za internu reviziju
Samostalni izvršioci izvan svih unutrašnjih jedinica